Нежинский краеведческий музей начал свою деятельность в 1968 году. Сегодня его фонды насчитывают более 44 000 оригинальных экспонатов, лишь часть из которых представлена для обозрения посетителей в четырех отделах: исторический, природоведческий «Природа Приостерья», художественный, «Почтовая станция» и фонды. Все они расположены в трех отдельных зданиях.
Исторический и природоведческий отделы музея разместились в двухэтажном кирпичном здании, принадлежавшем семье купцов Дяченко (построено в середине XIX века).
Постоянно действующая экспозиция исторического отдела размещена в 4 залах. В экспозиции представлены экспонаты, рассказывающие о жизни и быте Нежинщины, начиная с IV тысячелетия до нашей эры и по настоящее время.
Об историческом развитии края рассказывает археологическое собрание (каменные орудия труда, фрагменты лепной керамической посуды). Музей имеет интересные коллекции нумизматики, наград, полотенец ХIX-ХХ вв. холодного и огнестрельного оружия XVIII-XX веков, иконы и книги XVII-XX вв.
В экспозиции показано развитие города, освещены выдающиеся события, которые происходили в Нежине. Значительное место отведено выдающимся людям – уроженцам Нежина. Есть витрина, посвященная жизненному подвигу мореплавателя Юрия Лисянского т.д. Также уделено внимание М.В. Гоголю и Нежинской гимназии высших наук. Размещены образцы этнографической коллекции (традиционные народная одежда, бытовые вещи и т.д.).
Редкие экспонаты рассказывают о национально-освободительной борьбе украинского народа в XVIII – XX веках и освещают события Великой Отечественной Войны.
Отдел природы представляет вниманию посетителей образцы флоры и фауны Нежинского края. Здесь экспонируются окаменевшие ископаемые морской фауны мелового периода, возраст которых достигает 70 млн. лет; кости мамонта.
Художественный отдел музея разместился в отдельном помещении по ул. Батюка, 6. Экспозиция занимает 4 зала. В экспозиции представлены работы известных украинских художников С.Ф. Шишко, В. Добролижа, М.И. Стратилата, С.М. Рыбака, Ю.И. Галича, В.С. Шишко, П.С. Орла. Отдельный зал посвящен творчеству А. Г. Якимченко. Постоянно работает выставочный зал. В 2004 году к 150-летию со дня рождения в художественном отделе открыта новая экспозиция, посвященная жизни и творчеству Марии Заньковецкой.