Середня школа № 7 являється одним з найстаріших навчальних закладів міста Ніжина. Вона займає будинок, в якому 17 вересня 1878 р. почала діяти перша в Ніжині жіноча прогімназія. Заснував гімназію петербурзький золотопромисловець, уродженець нашого міста, А.Ф.Кушакевич у пам'ять про свою дружину П.І. Кушакевич.
У 1884 р. перетворена на гімназію. Містилася на вулиці Гоголя №15 у власному будинку, який 1900 р. був надбудований. Утримувалася за рахунок державних асигнувань, плати за навчання, пожертв та міських коштів. Плата за навчання 50-100 крб. (1915 р.). Гімназія мала 9 класів (7 основних, підготовчий і педагогічний), 421 ученицю. В гімназії викладались: Закон Божий, математика, історія, фізика, географія, природознавство, космографія, рукоділля, співи, чистописання, іноземна мова (за окрему плату). Гімназія мала свою бібліотеку.
З 1917 р. по 1919 р. в приміщенні гімназії П.І.Кушакевич працював в вечірній час ще один навчальний заклад - Ніжинська жіноча гімназія, яку заснував викладач математики ніжинської класичної гімназії Б.К.Римша за уповноваженням групи викладачів середніх навчальних закладів та Ніжинського історико-філологічного інституту. Вступний внесок 25 крб., плата за навчання – 100 крб. на рік. Учениць - 112 (1917 р.). Восени 1917 р. до обов'язкових предметів було включено українську мову та історію України.
В 1920 р. гімназія П.І.Кушакевич була перетворена на єдину трудову школу №1.
В 1941- 1948 р р. в приміщенні школи діяв госпіталь, а школа працювала в приміщенні філіалу школи №3 по вул. Леніна. В 1948-1952 рр. в школі було розміщено дитячий будинок для дітей військовослужбовців, які загинули в роки війни.
В 1950-1952рр. школа була чоловічою, а з 1952 р. – спільного навчання. В 1954 р. вона стала середньою школою №7.
Серед визначних викладачів школи була вчителька арифметики Г.Ф.Крестинська, за ініціативою якої в 1907 р. на кошти громадськості було відкрито другу жіночу гімназію М.Ніжина (зараз школа № 3).
Випускницями жіночої гімназії імені П.І.Кушакевич були:
- Марія Москаленко - мати видатного вченого, конструктора ракетно-космічних систем, академіка АН СРСР, двічі Героя Соціалістичної Праці С.П. Корольова;
- МО.Березюк - заслужена вчителька УРСР, розстріляна фашистами в період окупації Ніжина.
- В 1928 р. школу закінчив С.Ф.Шишко - Народний художник СРСР.
Серед випускників школи були:
- І.І. Гетьман - Герой Радянського Союзу, учасник знаменитого дрейфу на криголамі "Сєдов";
- Є.К.Зиков - відомий дослідник Антарктиди, ім'я якого носить один з островів поблизу материка;
- А.І.Тарнопольський - Герой Радянського Союзу, учасник Великої Вітчизняної війни;
- В.І.Масол - доктор наук, академік;
- І.Індик - академік;
- Д.Фащук - океанограф, доктор наук;
- Н.В.Лавленко - доктор наук, професор;
- Є.Третяков - доктор наук, професор;
- Ж.Тарнопольська (Пинтусевич) - чемпіонка світу з легкої атлетики, чемпіонка СРСР та України, фіналістка Сіднейської олімпіади.